安徽医科大学附属巢湖医院坐落在美丽的巢湖之滨，前身是中国人民解放军皖南军区陆军医院，1951年9月成立于芜湖市。1952年6月，奉命迁移至肥西张新圩，同年8月集体转业并移交省卫生厅，更名为安徽省第四康复医院。1954年3月迁到巢湖市现址。1960年7月，更名为安徽省立巢湖医院。1969年，医院下放巢湖地区，更名为巢湖地区人民医院。2000年，巢湖撤地设市，医院更名为巢湖市第一人民医院。2005年成为安徽医科大学第六临床学院。2006年3月被评为三级甲等医院。2010年成为安徽医科大学非直属附属医院。2012年12月，经省人民政府批准，医院移交安徽医科大学管理，更名为安徽医科大学附属巢湖医院。2014年9月，安徽医科大学实行临床学院与附属医院“院院合一”，医院同时为“安徽医科大学巢湖临床医学院”,学院下设精神医学系、全科医学系、医学心理学系三个学科系。2015年4月，医院成为17家省管医院之一。2017年7月，安徽省卫计委将“安徽省精神医学中心”挂靠在安徽医科大学附属巢湖医院。经过69年的建设和发展，已成为一家集医疗、教学、科研、预防、保健、康复等功能为一体的三级甲等省管综合性医院。
　　医院占地面积16万平方米，业务用房面积11.8万平方米。现有编制床位880张，开放床位1336张，临床科室38个，医技科室13个，教研室38个。年门诊量近90万人次，年收治住院病人5.3万人次。全院在岗员工1630人，拥有高级职称183人（其中主任医师41人），中级职称438人。医院现有博士生导师7名，硕士生导师49名。
　　医院拥有64排、16排、6排螺旋CT、3.0T超导型核磁共振、中能15兆伏直线加速器、数字血管减影系统（DSA）、DR、全自动生化分析仪、数字彩超、肺功能仪、人工心肺机、数字化胃肠机、钼靶乳腺机、电子胃肠镜、胰十二指肠镜、高清腹腔镜、手术显微镜、神经内镜、椎间孔镜、混合动力碎石清石系统、钬激光等大型医用设备，总价值2.4亿元。
　　医院全面实施创新兴院、人才强院、质量立院三大战略，注重医疗、教学、科研建设。现有省临床重点专科2个、省临床重点培育专科１个，国家住院医师规范化培训基地专业基地15个，安徽省江淮名医2人，省级以上学会主任委员7人，副主任委员40人。近5年获国家自然科学基金6项，省级科研项目20项，省科技进步二等奖1项、三等奖1项，发表专业论著915篇，其中SCI期刊92篇，中文核心期刊99篇。
　　医院始终秉承“博极医源、精勤不倦”的院训，坚持“救死扶伤、济世康民”的办院宗旨，不断改善服务质量，提高患者满意度，着力建成高水平、有特色的医科大学附属医院，赢得了社会各界的广泛赞誉。