盐田区卫生健康局下辖南方科技大学盐田医院、区妇幼保健院（计生中心）、区疾病预防控制中心、区卫生监督所、区卫生财管中心共5家单位。近年来，盐田区卫生健康局按照“特色化提升、差异化发展”思路，坚持以问题为导向，通过狠抓医德医风和干部队伍建设，全面提升医疗服务水平，切实改善患者满意度，力促辖区卫生健康事业跨越式发展和“弯道超车”，行业主管部门群众满意度以及公立医院医疗服务满意度稳居全市前列，先后被评为“全国社区卫生服务示范区”、“全国基层中医药工作先进单位”、“国家慢性病综合防控示范区”。

2016年出台《盐田区医疗卫生人才引进办法》，将医疗卫生人才分为高层次人才、技术骨干人才和后备人才三大类，分别给予高层次人才100-300万元的人才奖励补贴、技术骨干20-60万元的人才奖励补贴、后备人才3-10万元人才奖励补贴，奖励力度在全市各区处于较高水平。同时配套实施住房保障、配偶安置、子女入学、车牌补贴、父母居家养老服务、医疗保健等保障服务政策，解决人才的后顾之忧。

南方科技大学盐田医院是深圳市盐田区政府、南方科技大学合作共建的三级综合性医院，坐落在风景秀丽的梧桐山下，紧邻盐田区委区政府及 CBD核心区“壹海城”，交通便利，依山傍海、环境优美。2005 年被市政府列为“深圳市第七人民医院”，2017年合并原盐田区盐港医院、原梅沙医院及全部区属社康中心，组建深圳市盐田区人民医院（集团），2019年挂牌南方科技大学盐田医院，成为南方科技大学附属医院。医院含院本部、盐田院区二个院区，辖12个区域社康中心（站）。目前总占地面积近5.0万平米（不含社康面积），总建筑面积12.8万平米。

医院在岗职工1300余人，其中正高职称73，副高职称180人，博士12人，硕士研究生导师7人，硕士以上学历173人，开放床位729张，配置医疗设备总值达4亿多元，其中百万元以上设备72台。“十四五”期间，医院将完成各院区整体改造，总建筑面积将达到24.0万平米，开放床位1600张。

医院近年来快速发展，医疗服务水平不断提升，建立了深圳东部地区心脏康复中心，救治范围辐射深圳东部片区。2018年通过中国医院竞争力“五星级医院”认证，荣获国家卫健委医政医管局“2018年改善医疗服务”示范医院。2019 年医院胸痛中心成功通过国家胸痛中心认证。医院2019年正式挂牌南方科技大学盐田医院，成为南方科技大学医学院重要的医学教学、科研和技术实践基地，医院将借助南方科技大学雄厚的科研水平和创新能力，全面推动优质高等教育资源和临床医疗资源的深度融合，全面快速提升医教研水平。医院愿景是尽早建设成为技术精湛、服务一流、优势突出、特色鲜明的现代化三级甲等综合性医院，建成与现代化国际化创新型滨海城区相匹配的“深圳东部国际医疗中心”。