北京大学深圳医院位于深圳市行政中心福田区莲花山畔，是国家首批数字化示范医院、广东省智慧医院建设单位、广东省综合医院国家电子病历六级认证单位、国家卫健委“改善医疗服务行动计划示范医院”、深圳市急危重症患者转诊和治疗的区域性医疗中心。

医院现开放病床1670张，开设临床医技科室55个，医疗质量连续14年在深圳综合医院排名或A级。现有员工2600多人，其中高级职称764人，博硕士生导师112人，国务院特贴专家、国家领军人才等各类高层次人才42人。作为临床医学院，医院设立内、外、妇、儿等二级教研室23个，三级教研室27个，建立博士后科研工作站1个，博士培养点5个，硕士培养点37个，建立24个住院医师规范化培训基地。医院承担了包括北医口腔医学专业8年制博士生桥梁课在内的临床教学任务。

历经20年的发展，医院已形成了多个优势学科。泌尿外科是教育部重点学科;口腔医学中心是广东省高水平临床重点专科，重症医学科、骨科、肾内科、内分泌科、皮肤性病科、医学影像科和医学检验科等科室为广东省临床重点专科。此外，医院还拥有广东省转化医学、生物医学创新平台立项建设项目5个;国家临床研究中心深圳分中心3个（口腔疾病、肿瘤和老年病），质控中心1个（女性盆底功能障碍防治质量控制中心）;医院泌尿外科、妇产科、风湿免疫科、皮肤性病科、整形外科、肾内科和口腔医学中心等7个学科科技影响力跻身全国100强。

2019年7月，北京大学深圳医院入选广东省第三批高水平医院重点建设单位，医院正倾力打造集“大湾区区域性医疗中心”、“国际化医学科研创新中心”、“国家临床培训示范中心”、“现代医院管理制度创新中心”、“国家转化医学研究中心”及“高效率大健康管理中心”为一体的智慧型高水平医院。

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