始建于1986年的连云港市妇幼保健院，是一所集保健、医疗、教学、科研为一体的三级甲等妇幼保健院，扬州大学医学院附属连云港市妇幼保健院，徐州医学院教学妇幼保健院，市中医药高职校、淮安卫校、赣州卫校实习基地。占地面积28亩，建筑面积2.6万平方米，拥有床位369张，全院在职职工618名，其中卫技人员500余名，高级职称93名，中级职称161名，硕士以上研究生人员47余名，省市重点人才30余名。2013年，实现业务收入1.8亿元，门急诊45万人次，出院1.6万人次，手术7496台次，分娩数6564例。其中分娩数在市直医院遥遥领先。
该院开设十个病区，一个训练中心，拥有16排螺旋CT、基因分析仪、荧光定量PCR、数台三维、四维彩超、乳管镜、乳腺旋切系统、乳腺血氧功能成像系统、CPAP、钼耙机、干化学分析仪、三晶片腹腔镜、一体化产床、产科中央监护系统等大型精良设备。1994年被国家卫生部授予“爱婴医院”称号，先后荣获敬老文明号、省文明单位、省平安医院、市政府颁发的母婴安康工程、消防工作、社会保险工作先进集体、市卫生事业发展综合目标考评一等奖、省价格诚信单位、省计量工作先进集体、全国巾帼文明示范岗、江苏省五四红旗团支部标兵，多次荣获市文明单位、市卫生事业发展综合目标考评二等奖，该院同时还是江苏省新生儿疾病筛查中心连云港分中心、连云港市产前诊断筛查中心、港城一家人类辅助生殖、夫精人工授精技术临床专科医院。
近年来，人才、科教研工作实现历史性突破。顾莹入选市卫生系统领军人才和省妇幼重点人才，汤丽莎入选省市共建人才（卫生系统仅2名），骆秀翠入选省妇幼重点人才，闫冬梅入选省妇幼重点人才培养对象。2013年，获批省级科研课题3项，局级3项，市新技术引进奖三等奖1项，市青年科技奖提名奖1项，全年共发表论文96篇，其中SCI 2 篇，中华系列期刊1篇，核心期刊15篇，完成省级继续教育项目2项，市级继续教育项目9项。
该院主要开展群体保健、妇女保健、儿童保健、母婴保健技术培训、指导、适宜新技术推广、妇女儿童常见病诊治、产前筛查、产前诊断、新生儿疾病筛查、听力筛查、产科并发症处理、新生儿危重症抢救和治疗等业务。产前诊断中心、孕产妇和婴儿死亡综合干预项目、儿童哮喘防治中心被评为省妇幼重点学科,辅助生殖医学中心、新生儿医学中心被评为省妇幼重点学科建设单位，产前诊断与遗传性疾病诊疗中心被连云港市卫生局评定为市级十大诊疗中心之一。妇产科、新生儿科、儿保科、群保科、生殖健康与不孕症科、儿童康复科为市重点学（专）科，其中妇产科被评为市优秀重点学科。
群体保健科，省妇幼重点学科，该科以妇幼保健技术研究和政策研究为手段，以全面提高妇女儿童的健康水平为目的，指导全市妇幼保健技术服务的开展。主要负责对全市妇幼卫生工作的业务指导、培训及咨询;开展适宜新技术推广;对全市妇幼卫生信息的收集、整理、分析和反馈以及妇幼卫生信息系统的建设与管理工作;开展妇幼保健健康教育活动;协助卫生行政部门制定妇幼保健发展规划。2013年，实现两癌普查70000人次，全市新生儿筛查率、听力筛查率均达99。
儿童保健科作为本市儿童保健业务指导中心，主要任务是根据儿童的生理特点，开展经常性的预防保健、宣传教育、培训工作，以达到保障儿童身体健康，提高人口素质的目的。主要开展儿童保健、儿童营养、儿童听力测定、儿童心理、儿童康复、儿童眼保健、儿童耳鼻咽喉保健、微量元素测定、婴儿游泳、感觉综合训练等特色服务项目。2013年服务儿童近12万余人次，并率先在省内成立儿童康复中心。2010年，与北京大学医学院遗传中心、海军神经研究所合作开展干细胞治疗神经性疾病（小儿脑瘫）临床应用性研究。目前在江苏尚属，填补省内科研空白。
产科是省妇幼重点学科、市级优秀重点学科，开设四个病区，床位136张。该科设置产科ICU，担负着全市危重症孕产妇抢救指导、现场处理和转运接诊任务。2006年开通了85195199全市统一的呼救电话，实行了24小时值班制，进一步规范了急救流程，建立了孕产妇死亡防范和处置预案。该科为全市产妇实现了孕前准备、孕期保健（建立保健卡、免费为孕妇开设讲座、免费组织孕妇学习孕妇操）、导乐分娩、无痛分娩、家庭化分娩、产后康复等一条龙服务。其中无痛分娩、产后康复、孕妇学校在我市属于率先开展，特别无痛分娩市场需求成倍提升，2009年该院全面开展无痛分娩工作，专人负责，得到了广大产妇的普遍认可，目前无痛分娩已越来越被更多的产妇及家属接受。该院分娩量近年来一直位居市直医疗机构之首。
妇科作为市级重点专科，主要开展阴道镜、TCT、HPV规范化宫颈病筛查;微创治疗宫颈病变;宫腔镜诊治宫腔疾病、不孕;盆腔治疗仪治疗盆腔粘连、慢性盆腔炎;生物反馈治疗仪治疗张力性尿失禁;腹腔镜下不孕症诊治、子宫切除、肌瘤剔除术、卵巢囊肿剥除、附件切除术等业务。其中腔镜治疗是该院一大特色，在连云港市及苏北地区享有较高声誉，从2000年开展此项目以来，已经为8000余患者解除了病痛，腔镜治疗无痛、微创的特点已越来越被广大妇女所接受，在治疗子宫肌瘤、宫外孕、卵巢肿瘤、盆腔肿瘤等方面效果显著。
新生儿科是该院着力打造的品牌专科，2011年再次被评为市级重点学科，2012年入选省妇幼重点学科，配备了先进的消毒隔离措施、监护仪器、呼吸机、空氧混合仪、远红外复苏抢救台、CPAP机等仪器设备，为危重患儿及时、高效、的诊断和治疗提供了重要保障。近三年来，抢救危重症新生儿1000多例，成功率达98.5医疗事故发生，受到社会广泛好评。先后荣获连云港市科技进步三等奖、新技术进步奖各1项、医疗综合奖2项。
生育技术科组建于2000年，2012年入选省妇幼重点学科建设单位，下设普通生育技术科、生殖内分泌科二个二级科室，硕士以上4名，高级职称6名。主要开展夫精宫腔内人工授精、生殖内分泌疾病的诊疗以及不孕症规范化常规诊疗工作，每年实施夫精宫腔内人工授精200多个周期。多次荣获连云港市政府、市卫生局颁发的科技进步奖、新技术引进奖等奖项，先后承担省级课题1项，市局级课题10项。2011年5月6日，省卫生厅苏卫社妇[2011]8号、9号文正式批准该院人类辅助生殖、夫精人工授精技术进入临床开展，该项目在苏北率先开展，其中人类辅助生殖技术目前在苏北仅徐州妇幼保健院和该院具备临床准入资质，成为港城一家人类辅助生殖、夫精人工授精技术临床专科医院，正式开展规范性临床生殖技术服务。
儿科是院重点专科，担负全市儿童的医疗、教学、科研与康复的任务。技术力量雄厚，危重病抢救成功率95;对呼吸及哮喘类疾病治诊具有独到之处;精于儿童常见病、多发病的诊治，并以用药“灵、轻、便”享誉社会。护理单元率先开展“静脉留置针输液”，减少穿刺痛苦，赢得市民广泛赞誉。
儿童哮喘诊疗中心是全市率先成立的独立科室。2013年入选省妇幼重点学科。为了让哮喘儿童得到持续有效的治疗，该院依托硕士副主任医师于艳艳，设立专科门诊，开辟了港城儿童哮喘诊疗中心。该中心配备雾化吸入治疗室、过敏原点刺室、肺功能检测室，拥有国际标准化免疫治疗、儿童纤维支气管镜术等国内先进诊疗项目。为每一位就诊的患儿建立哮喘档案，设立电话随访制度，定期开设哮喘家庭规范化管理培训，目前已惠及近500名哮喘儿童，哮喘控制率接近100
妇女保健科是为女性各年龄阶段提供以保障生殖健康为重点的医疗和保健咨询的特色科室。如：青春期、婚育期、产褥期、哺乳期、更年期、老年期各阶段的保健服务以及婚前医学检查、婚前卫生咨询、婚前卫生指导、优生优育咨询指导、生殖健康咨询指导等。该科负责全市妇女工作的业务指导以及市区妇女保健工作，为各期妇女提供健康检查、健康档案管理、常见病防治、心理咨询、营养咨询、营养评价和指导的系列保健服务。
产前诊断、产前筛查、新生儿筛查是全市的江苏省指定医疗机构。其中产前诊断中心被评为省妇幼重点学科。2008年，产前血清遗传学筛查工作在全市四县四区全面推广开展。作为全市的产前诊断业务指导中心，该院还担负着全市孕中期妇女血清遗传学筛查、胎儿先天性畸形的超声筛查和产前遗传学诊断工作，对全市产前筛查进行技术指导、质量控制、出生缺陷筛查、诊断情况汇总和信息统计等妇幼保健工作。2013年产前筛查率达60并在苏北率先开展亲权鉴定项目。
该院同时还设立乳腺外科、小儿外科、内科、急诊科、生殖健康科、青春期保健科、口腔保健科、麻醉科、检验科、放射科、功能科、药事科、病理科、体检中心、皮肤科、耳鼻喉科、理疗科等，科室设置齐全。
在“十二五”规划政策引导下，该院将积极迎着港城大发展的大好形势，以创建基本现代化妇保院为目标，为全市的人民提供优质的保健医疗服务。
公交车路线：3路、6路、10路、18路、24路均可到达。